Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HABP4Q5JVS0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms