Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms