Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms