Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZBED5Q49AG3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZBED5Q49AG3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms