Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms