Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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