Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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