Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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