Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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