Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC37Q16543 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC37Q16543 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms