Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSRP2Q16527 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP2Q16527 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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