Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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