Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
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