Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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