Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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