Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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