Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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