Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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BRD3Q15059 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BRD3Q15059 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BRD3Q15059 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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BRD3Q15059 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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BRD3Q15059 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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BRD3Q15059 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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