Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1D2Q14995 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1D2Q14995 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms