Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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