Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF1Q13972 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRF1Q13972 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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