Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
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