Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms