Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SELENBP1Q13228 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SELENBP1Q13228 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms