Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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