Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RESTQ13127 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RESTQ13127 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RESTQ13127 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RESTQ13127 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RESTQ13127 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RESTQ13127 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RESTQ13127 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RESTQ13127 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RESTQ13127 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RESTQ13127 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RESTQ13127 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RESTQ13127 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RESTQ13127 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RESTQ13127 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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