Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MRPL28Q13084 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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