Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STX4Q12846 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STX4Q12846 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STX4Q12846 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STX4Q12846 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms