Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXO1Q12778 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms