Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CGNL1Q0VF96 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms