Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUCB1Q02818 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms