Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms