Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD1P98174 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD1P98174 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD1P98174 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD1P98174 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD1P98174 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms