Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF3P78545 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF3P78545 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF3P78545 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF3P78545 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms