Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4BP68371 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms