Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL23P62829 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL23P62829 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL23P62829 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL23P62829 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL23P62829 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms