Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS29P62273 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS29P62273 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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