Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFM1P61960 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFM1P61960 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFM1P61960 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms