Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP25P60880 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms