Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP12-1P59990 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms