Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMDP57764 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMDP57764 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms