Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE1P56817 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE1P56817 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE1P56817 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE1P56817 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE1P56817 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BACE1P56817 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BACE1P56817 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BACE1P56817 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BACE1P56817 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BACE1P56817 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BACE1P56817 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BACE1P56817 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BACE1P56817 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BACE1P56817 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms