Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLURP1P55000 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLURP1P55000 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms