Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1B3P54709 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1B3P54709 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms