Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3M2P53677 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms