Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP98P52948 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP98P52948 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP98P52948 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP98P52948 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP98P52948 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP98P52948 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP98P52948 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP98P52948 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP98P52948 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP98P52948 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP98P52948 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms