Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN1P49768 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSEN1P49768 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms