Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGM4P49221 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGM4P49221 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms