Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITPNBP48739 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms