Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A3P47895 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A3P47895 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms